Nommé d'après deux dirigeants africains anti-coloniaux, Jomo est né à Penang, en Malaisie, peu de temps après que le premier président kenyan Jomo Kenyatta a été incarcéré par les Britanniques à la fin de 1952 et des années après que le premier président ghanéen Kwame Nkrumah soit secrétaire du Congrès panafricain.
Après le lycée militaire en Malaisie, Jomo est parti aux États-Unis en 1970 après avoir eu une place à l'université Yale, et puis à l'université Harvard pour son master et doctorat.